分管医疗机构设置、等级创建、学科建设、医疗服务技术和行为规范、医疗技术应用推广、医疗质量、医疗安全管理、医院感染管理、临床用药及医疗器械临床试验管理、实验室管理、采供血管理、医疗废弃物处置、医务人员执业资格及执业准入管理、医务人员短期业务技能培训和医师定期考核、护理、康复、中医中药服务管理、中药产业发展、干部保健、院前急救、医疗卫生保障、卫生应急和紧急医学救援、征兵及大中专招生体检、国家药物政策和基本药物制度实施、医疗纠纷和事故调处、村卫生室及乡村医生管理、公立医院综合改革；红十字会；爱国卫生等工作。